Para implementar satisfactoriamente los lineamientos señalados por la PNASPI, se entendió la importancia de un programa de calificación de agentes de salud que trabajen para comunidades indígenas. En este contexto, surge el Programa de calificación de Agente Indígena de Salud (AIS) y Agente Indígena de Saneamiento (AISAN), siendo elaborado por i) especialistas en el área de la salud indígena; ii) docentes de Escuelas Técnicas del Sistema Único de Salud (ET-SUS); iii) Trabajadores de la Salud Indígenas y iv) Gerente del Consejo Distrital de la Salud Indígena (CONDISI).

El programa consiste en: […] una estrategia que tiene como objetivo favorecer la apropiación, por parte de los pueblos indígenas, de los conocimientos y recursos técnicos de la medicina occidental, no para reemplazar, sino para agregar a la colección de terapias y otras prácticas culturales propias, tradicionales.

Cabe destacar aquí que las acciones del AISAN incluyen “acciones/intervenciones en el campo de la vigilancia y saneamiento ambiental (operación/mantenimiento de sistemas de abastecimiento de agua; preservación de manantiales; disposición de residuos sólidos de aldeas), así como orientación/educación ambiental y en salud, […] crea posibilidades para mejorar el saneamiento ambiental y amplía la movilización de la comunidad para acciones de saneamiento y su relación con la naturaleza”. 

El AIS y el AISAN se distribuyen en todas las regiones del país y contribuyen activamente a los avances y las mejoras en la salud de los pueblos indígenas brasileños, especialmente en las acciones destinadas a reducir la mortalidad infantil, la cobertura prenatal, las mejoras en las condiciones sanitarias, el acceso al agua de calidad, el monitoreo de los niños, la vacunación y la vigilancia de la salud de la población indígena en general.